Ce glossaire explique les termes spécialisés de la biologie, de la botanique, de la zoologie et de la mycologie, ainsi que les termes utilisés en cécidologie. Il a pour but de faciliter la compréhension des nombreux termes spécialisés employés dans la galerie d’images et sur les pages d’information de ce site.
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Écies simples sans péridies (Caeomanies à caéomaspores). L’image montre un détail de Coleosporium tussilaginis sensu lato.

Le capillitium désigne l’ensemble d’un système de poils ou de filaments à l’intérieur des sporanges. En mycologie, le terme désigne principalement les structures filamenteuses de la glèbe mûre des gastrothèces, ainsi que des structures analogues à l’intérieur des sporocarpes des myxomycètes.

En cécidologie (science des galles végétales), le terme décrit une modification particulière des tissus provoquée par des organismes nuisibles tels que des insectes, des bactéries ou des champignons. Les galles cataplasmatiques ne présentent pas de rapports constants de forme et de taille. Presque toutes les mycocécidies sont de nature cataplasmatique, ainsi que les galles provoquées par des bactéries, des algues et de nombreux hémiptères. La taille de la galle résultante varie dans de larges limites.
La cécidologie est la science des galles végétales. Celles-ci sont provoquées par une grande diversité d’organismes, tels que les cynipidés, les cécidomyies, les tordeuses (papillons), les ériophyides, les champignons, les bactéries et les virus. Elles servent à la reproduction ou à la protection contre les conditions météorologiques et les prédateurs. Les galles végétales se forment de différentes manières. Chez les insectes, les tissus végétaux sont modifiés par l’injection de cytokinines, ce qui provoque les formes caractéristiques des galles. Ces injections peuvent stimuler, inhiber ou régénérer la croissance. On distingue les galles histoïdes et organoïdes. Les galles organoïdes se caractérisent par des modifications de certaines parties de la plante, telles que des changements de forme, des anomalies de disposition des feuilles et de ramification ou la formation de nouveaux organes. Les galles histoïdes se reconnaissent à des modifications des tissus végétaux, telles que des galles de feutrage, médullaires, d’entourage ou en poche, des enroulements et des pliures de feuilles. Les galles végétales peuvent également servir de refuge à des inquilins (espèces animales vivant dans des galles abandonnées mais encore occupées, des mines, des galeries ou les nids d’autres espèces) et à des parasites, ce qui entraîne généralement la mort du galligène.
Il existe environ 5 000 espèces de cécidomyies (Cecidomyiidae) dans le monde, dont environ 700 en Europe centrale. Elles doivent leur nom à la formation de galles sur différentes parties de leurs plantes hôtes, par exemple les graminées, les arbustes et les arbres, dans lesquelles se développe leur descendance. Des concentrations élevées de cytokinines ont parfois été trouvées dans les galles ; elles influencent la croissance et le développement des plantes ou des galles. Les cécidomyies, qui peuvent être en partie parasites ou prédatrices, passent la majeure partie de leur vie au stade larvaire. Les adultes ne vivent que peu de temps. Après quatre stades larvaires, les futures cécidomyies se nymphosent dans leurs galles. Les cécidomyies se nourrissent exclusivement de végétaux et ne transmettent aucune maladie à l’être humain.

La cellulose est le principal constituant des parois cellulaires végétales ; elle est ainsi le composé organique le plus fréquent et également le polysaccharide (sucre complexe) le plus abondant.
Les champignons imparfaits, également appelés Fungi imperfecti (Deuteromycetes), sont des représentants des champignons supérieurs (ascomycètes, basidiomycètes ou zygomycètes) dont le cycle de développement ne comporte pas de phase de reproduction sexuée ou dont celle-ci n’a pas encore été découverte. La reproduction s’effectue par des spores produites asexuellement (conidies) ou exclusivement de manière végétative.
En myrmécologie, on appelle fondation claustrale le processus par lequel une reine de fourmis fonde une nouvelle colonie de manière autonome. Après l’accouplement, elle perd ses ailes, s’enterre dans une chambre de fondation et la ferme. Elle y pond les premiers œufs, dont émergent ensuite les larves, les nymphes puis les ouvrières. Pour élever les larves, la reine puise dans ses réserves corporelles en dégradant les muscles du vol et le corps gras (réserves lipidiques de la gastre).
Désigne une fructification fongique dépourvue d’ouverture préformée ou de mécanisme d’ouverture particulier. La libération des spores se fait par altération due aux intempéries ou, lors d’une dispersion zoochore, par destruction mécanique et/ou chimique de la paroi, par exemple chez le géant des prairies (Calvatia gigantea).

Un cléistothèce est un ascome presque sphérique, sans ouverture préformée, à paroi simple ou multicouche. Les cléistothèces sont souvent entourés de cellules enveloppantes ou de péridies. La libération des spores se fait par destruction mécanique du cléistothèce ou par gonflement de structures internes qui provoquent son éclatement. Les cléistothèces sont notamment produits par les genres Emericella et Eurotium.

Les coléoptéro-cécidies sont des galles végétales provoquées par des coléoptères, par exemple des espèces de charançons (Curculionidae).
Rebord annulaire dans la chair du chapeau séparant les lames du pied, par exemple chez les lépiotes géantes (Macrolepiota), ou structure annulaire en forme de collerette, par exemple sur l’endopéridie des géastres (Geastrales).

Le commensalisme désigne une forme d’interaction entre des individus d’espèces différentes qui est positive pour les individus d’une espèce et neutre pour ceux de l’autre. Le terme est utilisé dans différents domaines avec des définitions légèrement différentes. Dans la définition originale, issue des travaux du parasitologue et paléontologue belge Pierre-Joseph van Beneden, un commensal est un « convive » qui dépend, pour son alimentation, d’un organisme d’une autre espèce en partageant sa nourriture, mais qui ne lui cause pas de dommage, contrairement au parasitisme. Lorsqu’ils vivent étroitement associés, l’organisme qui fournit la nourriture est appelé hôte et celui qui en profite est appelé commensal. L’hôte ne subit ni avantage ni inconvénient. Seul le commensal tire profit de cette association et il dépend généralement de l’hôte. Il se nourrit principalement de déchets ou de l’excédent alimentaire de l’hôte, sans lui retirer de substances indispensables à sa survie.
Les conidies sont une forme particulière de spores chez les champignons, mais aussi chez les procaryotes du genre Streptomyces. Chez les champignons, elles appartiennent aux mitospores et sont donc produites de manière asexuée (mitotique) à l’extérieur du sporange, par transformation d’hyphes ou sur des conidiophores. Elles constituent les organes de dissémination caractéristiques de la reproduction végétative des champignons supérieurs (ascomycètes et basidiomycètes).

Fructification des champignons imparfaits chez lesquels se forme une paroi de fructification nettement différenciée.
Un conidiophore (également appelé conidiophore porteur de conidies) est une hyphe portant des conidies et se distinguant nettement du mycélium végétatif.
coprophile = relatif à la bouse, au fumier ou aux excréments.
En mycologie, les champignons coprophiles sont des espèces qui se développent de préférence ou exclusivement sur les excréments animaux (bouse, fumier, etc.).
Le cortex est la couche corticale des fructifications des champignons.
Enveloppe protectrice filamenteuse ou en forme de voile, située principalement entre le bord du chapeau et le pied, par exemple chez les cortinaires (Cortinariaceae).

Une cryptospèce, ou espèce cryptique, est en biologie un groupe (population) d’organismes morphologiquement indiscernables, chez lequel la reproduction sexuée avec d’autres individus jusque-là considérés comme appartenant à la même espèce est impossible ou ne produit que des descendants non fertiles. On parle également d’isolement reproductif. Comme un critère important de la définition d’une espèce (la capacité à se reproduire entre eux) n’est pas rempli, ces organismes ne peuvent pas appartenir à une seule et même espèce.
Pouvant être coloré par le bleu d’aniline, le bleu de méthyle ou le bleu coton ; important pour la coloration des ornements sporaux, par exemple chez les champignons coralloïdes et les discomycètes.
Les cynipidés (Cynipidae) comptent environ 1 600 espèces dans le monde et environ 300 en Europe centrale. Les cynipidés se développent principalement dans les galles végétales, mais aussi chez d’autres insectes en tant que parasites ou parasitoïdes. La reproduction est soit normalement sexuée, soit en partie parthénogénétique. Chez la plupart des espèces, il existe toutefois une alternance de générations, avec une génération sexuée et une ou plusieurs générations parthénogénétiques. Les larves se développent dans les galles, qui apparaissent sous l’effet de stimuli chimiques et/ou mécaniques, et se nourrissent de leurs tissus.

Cellules stériles qui se distinguent nettement des cellules environnantes. On trouve des cystides dans la couche fertile (cystides hyméniales), sur l’arête des lames (chéilocystides), sur la face des lames (pleurocystides), dans la cuticule du chapeau (pilocystides) et à la surface du pied (caulocystides). Les cystides dont le contenu réfringent devient jaune avec la KOH (hydroxyde de potassium ou potasse caustique) sont appelées chrysocystides. Les cystides à contenu huileux sont appelées gloéocystides. Avec la sulfovanilline, leur contenu devient rouge vineux.
Les cytokinines sont un groupe de phytohormones qui influencent la croissance et le développement des plantes. On en trouve également dans les tissus animaux, les bactéries, les champignons et les algues.