Los endoparásitos [de *endo-, griego parasitos = parásito], también llamados parásitos internos, son organismos que viven en el interior de otros organismos (en casos extremos, dentro de las células) durante un período prolongado o durante todo su ciclo vital y obtienen alimento de forma parasitaria. Según el lugar donde se encuentran, entre los endoparásitos animales se distinguen, por ejemplo, los parásitos sanguíneos y los parásitos intestinales. En estos últimos, las piezas bucales y el aparato digestivo (intestino, digestión) suelen estar completamente reducidos, y la absorción del alimento se realiza a través de toda la superficie corporal. Ejemplos de endoparásitos animales son el protozoo Trypanosoma, las tenias, el molusco Entoconcha y el tábano gástrico Gasterophilus (Gasterophilidae). También viven como endoparásitos diversas bacterias y hongos (p. ej., Coryneliales, Exobasidiales; endoxilófitos). Asimismo, plantas superiores como representantes de las Rafflesiaceae (Cytinus, Rafflesia) pueden considerarse endoparásitos: atraviesan, como los hongos, el tejido de sus plantas hospedadoras y solo lo atraviesan para formar las flores.

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